国家数据局下设的五个司局名称目前已经正式确定为：综合司、政策规划司、数据资源司、数字经济司、数字科技和基础设施建设司。
国家公务员局公开的面试计划资料显示，2024年2月25日，国家数据局综合司、政策规划司、数据资源司进行了拟招录的工作人员的面试，数字经济司、数字科技和基础设施建设司在2月24日进行了面试。
国家数据局依据2023年3月中共中央、国务院印发的《党和国家机构改革方案》组建，2023年10月25日正式揭牌。
2023年3月，党和国家机构改革方案明确的国家数据局职责为：负责协调推进数据基础制度建设，统筹数据资源整合共享和开发利用，统筹推进数字中国、数字经济、数字社会规划和建设等，由国家发展和改革委员会管理。方案同时决定将中央网络安全和信息化委员会办公室承担的研究拟订数字中国建设方案、协调推动公共服务和社会治理信息化、协调促进智慧城市建设、协调国家重要信息资源开发利用与共享、推动信息资源跨行业跨部门互联互通等职责，国家发展和改革委员会承担的统筹推进数字经济发展、组织实施国家大数据战略、推进数据要素基础制度建设、推进数字基础设施布局建设等职责划入国家数据局。